e-rukovodstvo.ruТихоокеанский лосось является основополагающим видом прибрежной экосистемы Британской Колумбии и на протяжении тысячелетий был ключевым источником питательных веществ и энергии для некоторых из самых важных видов в Канаде, включая медведей и касаток. Некоторые популяции диких тихоокеанских лососей резко сократились с начала 1990-х годов. Например, более половины всех популяций лосося чинук в южной части Британской Колумбии находятся под угрозой исчезновения. В течение десятилетий ученые пытались точно определить причины этого.
Вирус
Причина оказалась в вирусе. В новом исследовании, опубликованном в журнале Science Advances, мы обнаружили, что вирус лосося, распространенный на рыбных фермах, был завезен в южную часть Британской Колумбии примерно 30 лет назад и постоянно передается между выращенным на фермах и диким лососем.
Рыбные фермы и риск распространения вируса
Большое количество и плотность атлантического лосося означает, что существует высокий риск развития заболеваний. Поскольку вирусы и другие инфекционные агенты обычно встречаются на лососевых фермах, некоторые ученые назвали эти места «объектами для культивирования патогенов». Экологические группы и промышленность регулярно обсуждают, распространяются ли эти патогены и вызывают ли болезни в популяциях диких рыб.
Рыбий ортореовирус
Одним из наиболее обсуждаемых вирусов является рыбий ортореовирус (PRV). PRV часто встречается в лососеводстве и вызывает сердечные заболевания у атлантического лосося. Тем не менее правительство и отраслевые группы утверждают, что PRV является эндемичным для Британской Колумбии и представляет не более чем минимальный риск для нерки реки Фрейзер.
Лосось на лабораторном столе
Ученые препарируют ткани диких тихоокеанских лососей для молекулярного анализа и секвенирования вирусных геномов. Слово «эндемик» имеет два значения. Экологи используют его для описания растений и животных, произрастающих в регионе. Но эпидемиологи пользуются им для обозначения постоянного и стабильного присутствия инфекционного агента в определенной области.
Вирусы оставляют генетический отпечаток
Секвенирование генома может быть использовано для мониторинга эволюции вируса, как мы видели это во время пандемии SARS-CoV-2. Мы применили те же методы для отслеживания путей различных линий PRV в разных масштабах: между океанами и локально у различных популяций лосося у побережья Британской Колумбии.
Частота мутаций вирусов высока, и со временем в их геномах накапливаются генетические различия. Эти изменения в геноме позволяют понять происхождение и распространение вирусов, отобранных из разных мест.
Дальнейший анализ геномов PRV в водах Британской Колумбии показывает, что за последние два десятилетия число случаев заражения PRV в регионе увеличилось на два порядка, что согласуется с региональным ростом количества ферм, где болеет почти вся рыба. Все варианты вируса, включая тип PRV, обнаруженный в Британской Колумбии, вызывают поражение сердца у атлантического лосося.
Тот же вирус, другая болезнь
Что еще более важно для экологии Британской Колумбии – это то, что PRV был связан с другой болезнью тихоокеанского лосося. У чавычи PRV ассоциируется с желтухой и анемией — заболеванием, которое является результатом разрыва эритроцитов, приводящего к повреждению печени и почек.
Несмотря на доказательства, связывающие PRV с заболеванием как атлантического, так и чинукского лосося, Министерство рыболовства и океанов (DFO) не классифицирует PRV в качестве возбудителя патологии. Из-за этого океанские рыбные фермы продолжают снабжаться лососем, зараженным вирусом.
Таким образом, результаты показывают, что лососевые фермы являются источником инфекции для диких рыб. В определенных кругах растут призывы свести к минимуму взаимодействие между разведением лосося и дикой рыбой.
